يجب تقسيم غرف العمليات بشكل صارم إلى مناطق محظورة (غرف عمليات معقمة)، و-مناطق شبه محظورة (غرف عمليات ملوثة)، ومناطق غير محظورة. هناك تصميمان لفصل هذه المناطق الثلاث: الأول هو وضع المناطق المحظورة وشبه المحظورة-في طوابق مختلفة، مما يسمح بعزل صحي شامل ولكنه يتطلب مجموعتين من المرافق، ويزيد من عدد الموظفين، وغير مناسب للإدارة؛ والآخر هو أن تكون هناك مناطق محظورة وغير مقيدة في أقسام مختلفة من نفس الطابق، مع وجود منطقة شبه محظورة بينهما، لمشاركة المعدات. هذا التصميم أكثر ملاءمة للإدارة.
تشمل المناطق المحظورة غرف العمليات المعقمة، ودورات المياه، والغرف المعقمة، وغرف تخزين الأدوية. تشتمل المناطق شبه المحظورة- على غرف العمليات الطارئة أو الملوثة، وغرف تحضير الأدوات وتضميد الملابس، وغرف تحضير التخدير، وغرف التعقيم. تشمل المناطق غير المقيدة غرف تغيير الملابس، وغرف الجبس، وغرف العينات، وغرف التخلص من النفايات، وغرف إنعاش التخدير، ومكاتب الممرضات، وغرف استراحة الموظفين، وقاعة الطعام، وغرفة استراحة لعائلات مرضى الجراحة. يجب أن تكون غرفة العمل ومكاتب الممرضات بالقرب من المدخل.